，在速度和灵活上扎夫特的高速战舰占据优势，能够快速的回避敌人的炮火和调整战斗方位，当然双方都有几艘倒霉的战舰尚未开始MS战就被击沉了。
在确定各自战舰在敌人主炮的范围外后就开始下一阶段的作战，各个战舰纷纷派出了他们的MS小队，在两支舰队的中间展开了大规模的MS激战。六百多台MS让联合军在数量上zhan有绝对优势，扎夫特只有三百多台MS只能靠机师自身的技术和素质挽回数量上的差距，数量和质量是联合军与扎夫特之间的最大区别。
－－－－－－－－－－－－分界线－－－－－－－－－－－－
第一精英MS作战联队是刚刚成立的部队，他们的成员来之联合军各支舰队，唯一的相同处是他们是各自舰队的王牌。
艾森。威尔原来是第九独立分舰队的王牌，他驾驶着闪电强袭高达改在第九独立分舰队覆灭后，他被分配进入了第二舰队，担任旗舰的MS小队队长一职，现在他有被调进了新成立的精英MS大队联队，成为大队的一名小队长。可是威尔并没有感到不满，相反他感到浑身热血，因为他得知这支部队将会作为联合军牵制S机师专用的特殊反应部队。威尔在第一次
威尔注意到除了自己以外还有许多其他著名的机师。例如第四舰队外号“开膛手”的爱德华&；#8226；哈勒森。爱德华是驾驶着的机体是巨剑型瘟神高达改。爱德华是一名32岁的棕色发色深色皮肤的南美籍军人。他参加过第一次大战，在第一次大战后叛离联合军倒戈南美革命军，可是又在第二次大战中加入了联合军，原因很简单因为尤尼乌斯的碎片掉落在他的家乡，将他的家乡毁灭了。他擅长近战运用大剑切割敌人的机体，现在他成为了精英MS王牌大队的一员。
第二舰队的“月下的狂犬”摩根。雪佛兰是一名金发的中年男，留着胡子年龄已经52岁了，可是他依旧爱好冲锋在最前线。他是新成立的第一精英MS王牌大队的队长，擅长指挥MS作战，擅长在地面上运用击中兵力战术一点击破敌军防线，是大西洋联邦MS作战理论的奠基者之一。摩根驾驶着一台改装炮击型亥伯龙短枪队长专用机。
第一舰队的“白鲸”珍。休士顿是一名漂亮的金发美女，她驾驶着改装过的强化火炮型温达姆队长机。威尔十分欣赏这位美女，可是威尔的举止并不敢过分，因为听说她可是一头母老虎，当初为大西洋联邦组建了潜艇部队，被扎夫特的海中MS击溃后，又组建了实验型的联合军海中MS抵抗扎夫特的海中MS，是一个标准的女强人。不少企图在她家里过夜的男人，都没有好受过。
第一舰队的“乱樱”蕾娜。伊梅里亚黑色长发美女日美混血，驾驶着一台速度至上的改装过的导弹型迅雷高达，据说她的战斗方式就像樱花一样灿烂和美。
还有一名让威尔感到神秘的人物卡纳得。帕尔斯，他自称是来之从未在月球本部出现，传说中的第十独立分舰队，威尔从来也没有听说过他的名字。这个男孩长着一幅俊俏的脸蛋，留着一头长发，如果不是皮肤稍微有点深色，穿着女装的话，也许威尔会以为他是个女孩。帕尔斯驾驶着是一台威尔没有见到过的机体，白色的机体，帕尔斯称说这台机体是白色勇士队长机，是一台白色勇士的改装型号，虽然威尔不知道什么是白色勇士，也不知道这类机体是哪国制造的，可是直觉告诉威尔帕尔斯绝对没有他自己说的那么简单。从帕尔斯的眼瞳中威尔可以看出许多复杂的心情，帕尔斯也是背负着许多不祥的往事。
还有一个小女孩，一个很可爱的红色长发的女孩。每次来都是由一名名叫做卡兹的中校带着，威尔怎么也看不出她是一个王牌机师，因为她实在太年幼了，威尔估计她顶多只有16岁。这个女孩并不经常出现，只有当大家统一展开战术研讨，研究作战方式的时候才会参加会谈，平时都在第四舰队的炽天使号。女孩的坐骑是一台奇怪的巨型MA，这个女孩的名字叫做。。。
一百一十四 狩猎旗舰
基拉驾驶着自由天使和飞鸟。真兵分两路，前往执行狩猎敌军旗舰的特殊任务。基拉的目标是第一舰队的旗舰智天使号，通过远程摄像扎夫特的情报识别员们找到了智天使号的具体位置，战术指导员们在根据敌舰的位置设定出最好的单机突击路线。基拉再根据计划制订的路线穿梭到达敌舰旁，然后击毁敌舰。听上去仿佛是很容易的一个任务，其实是一次无比艰辛的任务，需要突破敌人数多层的严密火力封锁网和数十支MS大队的防御阵线，是一个危险系数极高的任务。设定具体计划的情报官和参谋们甚至认为是不可能达成的任务，可是介于三位参谋长的坚决态度，参谋们对传说中的S级机师也许可能完成任务持有幻想，这次任务被敲定了。
基拉已经穿过十道严密的火力封锁网和十多支MS大队了，基拉以不可思议的灵巧性回避着敌人的火力，以极快的速度在敌人能够反应前穿梭过一支又一支MS大队。可是当他即将要抵达目标前，一支精英大队将基拉给缠住了。
基拉地给这支部队打分道：这支精英大队没有统一的MS标准。大西洋联邦改良特装型温达姆、欧亚联邦的亥伯龙改装型、导弹型迅雷高达、还有稀奇古怪的巨剑高达，各式各样的改装专用MS都有，作战能力却很强，协同作战上虽然有一丝不协调，但总体上还是很不错的。
如果基拉肯下狠心的话，也许现在基拉已经突破了敌人的防线，可是他不愿意下杀手，所以被敌人纠缠住了。
当威尔得知进攻的敌机可能就是当初在奥布的那名S级机师，威尔浑身颤抖，并不只是恐惧而生的颤抖，更多是兴奋，威尔感觉到兴奋。他离自己的梦想又接近了一步，如果运气好击倒对方的话，也许威尔的梦想就能够实现了。虽然威尔很清楚自己的实力和对手的差距，可是威尔并不害怕，相反他感到兴奋。
当基拉进入了第一精英王牌大队的防线，闪电强袭首先瞄准了基拉的自由天使，两道电磁加农炮射向基拉，可是却被基拉迅速的回避了。
“月下的狂犬”摩根。雪佛兰驾驶着炮击型亥伯龙短枪，肩膀上的两筒卡尔特人火箭炮发出了十六枚飞弹射向基拉。基拉展开了攻击翅膀，十二枚攻击翅膀瞬间将火箭炮一一射爆。
“乱樱”蕾娜。伊梅里亚驾驶着导弹型迅雷高达突然在基拉的后方出现，原来她之前一直隐身着，突然间数发跟踪导弹瞄准着基拉的正后方射出，基拉没有回避也没有转身，可是攻击翅膀仿佛长了眼睛似得将导弹一一击落，
同一时间“白鲸”珍。休士顿强化火炮型温达姆队长机握着加强光束加农阻击炮瞄准着基拉侧面连续射击，可是炮弹还没有击中基拉，基拉的自由天使就失踪不见了，当珍再次察觉自由天使的位置时，火炮型温达姆队长机已经被基拉砍断了双腿和双手了。
威尔无法接受眼前的事实，难道实力的差距就这么多吗？
突然一台白色的机体出现了，是来之神秘的第十分舰队的神秘人卡纳得。帕尔斯驾驶的白色勇士队长机，帕尔斯发疯似的冲向了基拉，手上的加农机关枪迅猛的加农子弹不断射在自由天使的VPS装甲上，加农机关枪的优点就是射速快，缺点就是杀伤力低，虽然帕尔斯成功射中基拉，可是除了在VPS装甲上留下弹痕几乎没有什么效果。
帕尔斯飞到基拉身前，仍丢了机关枪，拔出了光束刀刺向基拉，基拉躲过了帕尔斯的刺杀。可是帕尔斯奋勇的战斗鼓舞了周围的其他队员。
“月下的狂犬”摩根。雪佛兰透过通讯器喊道：“还看什么，还不快点上帮助帕尔斯！”
“月下的狂犬”摩根。雪佛兰的亥伯龙短枪握着手上的加农火箭筒瞄准着基拉不断射击，一发又一发的火箭炮射向基拉，虽然没有命中，可是却帮助帕尔斯打乱了基拉的反攻。
众人纷纷受到鼓舞和觉悟，拔出了各自的武器向基拉攻去。
－－－－－－－－－－－－分界线－－－－－－－－－－－－
那一天晚上在拉尼陨石补给站的看到史黛拉后，飞鸟就变得沉默寡言了，原本和史黛拉约定好第二天见的，可是当飞鸟第二天去找她时，敌舰已经离开了拉尼补给站的维修厂。飞鸟虽然想到史黛拉可是只能寄托于思念。。。
这场会战中飞鸟的任务是击毁第四舰队的旗舰权天使号，飞鸟不同基拉。大和唯恐破坏自己虚伪的理想不杀主义，而不敢轻易动手。飞鸟肆意地杀戮，甚至有一种将思念史黛拉的情绪发泄在杀戮当中。。。
飞鸟根本就没有数自己到底突破了多少支MS大队，毁灭了多少台MS，他的脉冲命运就像一台来之地狱的恶魔，挥舞着红色的翅膀光之翼，收割着敌人的生命。
结束这场战争，想办法将史黛拉救出，就是飞鸟的唯一信念。。。这股信念维持着飞鸟以不可思议的速度突破敌人的防线。
可是当飞鸟要抵达目的地时。。。。三台敌军的高达出现了。
高达30多米的棕色重高达、实验型意念感应高达N和能天使高达三台强化人操纵的高达挡在飞鸟的前方。
三台敌机虽然难缠，可是在飞鸟的眼中对手的操作技术和速度还是太弱了，凭着要结束这场战争，想办法将史黛拉救出的信念，飞鸟启发了体内的SEED。
躲过了重高达三发列位相对能量炮、意念感应高达N的攻击浮游炮、能天使高达的高能光束炮。反而将以高达N攻向自己的三枚攻击浮游炮一一击毁，将能天使高达高能光束炮斩断，正当飞鸟打算将重高达的驾驶舱射爆时。。。
突然一种从来没有体会过的感觉进入了飞鸟的大脑神经，飞鸟一霎那间看到了重高达内的驾驶舱，一个女孩。。。一个金发女孩在驾驶舱内喘息着，用着愤恨的眼神望着自己的脉冲高达，飞鸟凝视着女孩茫然无辜的愤恨眼神。。。她是史黛拉。。。这台棕色巨型高达的机师是史黛拉！？
飞鸟的原本打算射�