见李定国连胜清军，孙可望也想露一手。
岔路口之战，孙可望遭到重创，被清军打得大败，奔返贵阳。清军大掠靖州、辰州、沅州等地，杀死平民数十万人，千里丘墟。至此，孙可望再不敢产生与清军争胜之想，只想保持割据一方的地位。
四川方面，孙可望派去的刘文秀一军在永历六年秋天连连取胜，最终把吴三桂等数部清军打得退守保守（今四川阆中）。当时清廷已经下令，决定让清军放弃全川，退回陕西汉中一带，全保陕地。
可惜的是，刘文秀不知“穷寇莫追”之说，死缠烂打保宁城内的清军，孤城之下犯险，最终反被吴三桂孤注一掷的决死战法击败。结果，数万明军被杀，清军死里逃生不说，实现了全面大翻盘，刘文秀率残军退回贵州。
本来就恨刘文秀与李定国穿一条裤子，孙可望抓住机会，削夺刘文秀兵权，把他发回昆明软禁。
保宁战斗结束后，身经百战的大汉奸吴三桂感叹：“我生平交战无数，平生未遇如此劲敌！”富贵险中求，吴三桂为清朝又立全取四川的大功。
安龙方面，孙可望对永历君臣一直严加注意。其间，本为永历帝亲信的马吉翔，一直向孙可望投怀送抱。
这位马古翔，北京大兴人，市棍出身，本性狡黠，是个知书识字的高级地痞。他年青时代在北京给宫内太监家中当仆人，后为书办（太监的文字秘书），在太监圈子里人缘很好。后来，他跟随太监高起潜出外监军，窜入锦衣卫籍，获得都司之职，开始有了政治发迹的本钱，送银送物之下，被外派为广东都司。所以，北京甲申之变，马吉翔本人正在广东，逃过一劫。隆武帝在福建继位，马吉翔自陈原本是锦衣卫世家出身，获授锦衣卫指挥，冒升为皇帝身边的禁卫军高级首领。他奉命到湖南等地巡视时，玩命巴结当地诸将，只要有鸡毛蒜皮的功劳，就要在奏表中放入他自己的名字，于是连连升官，很快做到“总兵”。永历帝继位，马吉翔给新皇身边的人广送厚礼，得封文安侯。
由于马吉翔自小行走于太监门下，他深知巴结皇帝身边宦官的重要性。成日小恩小惠，刻意交结打点，使得宦官们心甘情愿为他当耳目。所以，永历帝一举一动，他无不预知。
由于善于迎合，十分乖巧，永历帝与其母特别喜欢这位马侯爷，认定他忠勤无比，让他操持朝廷戎政大权。
到了安龙，永历帝落地凤凰不如鸡，马吉翔自然要另攀高枝，遂与提掌禁卫军的太监庞天寿交结孙可望，想逼永历帝禅位孙可望，谋求大富贵。
为此，他持白绫一幅以及数锭金元宝，找到善画的武选司郎中古其品画一幅《尧舜禅让图》，准备献给孙可望。
古其品不像现在的“艺术家”们那样人格卑下只为钱，愤怒拒绝。马吉翔为此向孙可望偷偷告状，古其品被孙可望抓去贵阳，活活打死。
为了凸显马古翔和庞天寿二人的威权，孙可望特意向安龙发来指令，表示说朝廷大小机务，一概由二人秉持。如果有大臣“犯法”，也由二人全权处理。
永历帝渐知马吉翔对自己不忠，很想杀掉他与太监庞天寿，但慑于孙可望势力，不敢轻易下手。马吉翔与孙可望手下大臣方于宣等人密切勾结，想改国号为“后明”，立孙可望为帝。
忧急之下，永历帝对亲信内监张福禄说：“孙可望无夏人臣之礼，奸臣马吉翔、庞天寿为其耳目，朕寝食不实。听说李定国精忠报国，军声大震，希望你们能把朕密敕交予他，让他来救出朕身虎口，脱离孙可望控制。”
内监张福禄出主意，他告诉永历帝说，言臣徐极、林青阳、胡士端等人一直一疏劾奏马古翔，可让他们想办法联系李定国。于是，林青阳以请假回家奔丧亲为名，前往李定国处联络。
马吉翔不久得知此事，即刻派人密告孙可望，说永历君臣已经联系李定国，准备“谋反”。
孙可望大怒，立刻派亲信郑国率兵入安龙问罪。
最后，牵引勾连，包括大学士吴贞毓在内，十八个大臣被尽数逮捕，最后判罪：“欺君误国，盗宝矫诏”，皆处以死刑。
永历帝忧愤至极，也救不得人，眼睁睁看着十八个大臣被孙可望军人处死，这就是南明的“十八忠臣案”。
这些人虽然都是文士，皆慷慨悲歌，与朝臣纷纷赋诗作别，勉励说：“我们这就样去了，中兴大业，交予诸位。希望诸位忠于朝廷，切不可像马吉翔、庞天寿那样卖主求荣。能如此，我们虽死犹生！”
言毕，诸忠臣引颈受戮。
十八忠臣即死，永历朝廷在权皆归马吉翔、庞天寿，完全成为贵阳孙可望的傀儡附庸。
跋扈更胜曹孟德——孙可望的一意孤行
杀掉永历帝手下十八文臣后，为了阻止李定国迎驾，孙可望派手下总兵张明志、关有才二人率兵前往广西，准备趁机袭攻李定国。
当时的李定国，刚刚处于二次入粤新会大败之际，手下残兵仅仅一万多人，驻扎于广西南宁，势单力弱。
听闻张明志、关有才二人提数万精兵前来，计出无所，他急召手下文士金维新和总兵曹延生商议对策。这二人倒是不慌，他们讲：“张、关二人所率兵马虽多，大部分都是您昔日的部下，安敢相敌。张明志从大路来，我们可从归朝土司小路走，抄其后路，定然大胜。然后，我等率兵趋安龙，迎皇上入云南，此举名实并收！”
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永历朝廷活〃曹操”（6）
李定国依计，率兵从小路抄张明志等人的后路，果真一举成功，大败来军。除跑掉的兵卒外，又得残兵数千人，连夜直奔安龙。
孙可望听说张明志兵败，料定李定国定要去安龙迎永历帝，就派大将白文选率数百精兵从贵阳出发，要他迅速劫走永历帝。
他算计得很好，但没料到白文选归附明朝后一直与南明四川巡按钱邦芑关系密切，心向帝室。所以，他到安龙后，一直以无运输工具和马俱为借口，拖延不去，等待李定国来安龙。
缓了两天，终于等来李定国大军，白文选大舒一口气。
李定国送白文选回贵阳前，动情地说：“我与秦王，原无嫌隙，义为兄弟，应该同辅国家，如此，天下何事不可为！希望你回贵阳后，代我二人调停，我将拥戴圣驾入昆明。”
面君之时，李定国对永历帝竭尽忠诚，倾诉肺腑。
永历帝颠沛久之，见有如此纯臣来护，感动得泪下沾襟，他拉着李定国之手说：“久闻忠义，恨见卿晚！”
于是，永历十年（1656年，顺治十三年）月底，一行人拥永历帝前往昆明。行至曲靖，李定国请永历帝暂驻跸，他本人率军先去昆明。
昆明城内，有孙可望的手下抚南王刘文秀和固原侯王尚礼。周边地区，大将王自奇驻军楚雄，大将贺九义驻军武定，共约二万多人。除刘文秀以外，其余三将皆是孙可望心腹。还好，昆明城内还有明朝的黔国公沐天波，他与刘文秀一道，劝几位将领迎永历帝入城。
本来几个人还想拒绝，无奈李定国来得快，孙可望与永历帝又没有正式撕破脸，三将不敢明白相抗，只能与刘文秀、沐天波一起出城相迎。
由此一来，永历帝终于进入昆明，找到一块根据地。
永历帝这次很“大方”，立刻封李、刘二人为“一字王”，李定为“晋王”，刘文秀为“蜀王”，并晋升白文选、王尚礼等人皆为公爵。
昆明城中，孙可望心腹中最狡黠的是张虎，他只得个淳化伯的爵位，怏怏不快。
众人商议，借着派张虎议和为名，把他打发前往贵阳。
临行，永历帝从头上亲拔金簪一枝以赐张虎，说：“秦晋二王，义当和好。和议若成，必封爱卿为公爵。以此簪赐卿，以为信物！”
张虎临行，密见王尚礼和王自奇二将，说，“我此行不久，必与秦王整兵来取云南，不知你二人如何接应？”
王自奇：“王尚礼可率亲兵在昆明城内为内应，我兵马驻扎楚雄一带，只要秦王来攻，我定出兵楚雄，夹攻之下，二十万大军，对李定国、刘文秀三万兵，定能得胜。”
张虎到达贵阳后，立即把永历帝封他为伯爵的印信交给孙可望，丑表功说：“当时如果我不受封，恐怕因疑被杀。臣受国主您厚恩，岂能相背！”
接着，他取下头上金簪，“臣临行时，皇上赐我此物，让我刺杀国主报功，答应封我二字王，臣不敢忘恩，告知国主。”
这一番添油加醋，激得孙可望更加愤怒。
见火侯已到，张虎又劝：“皇上在云南，端拱而已。内外大权，皆归李定国。而李定国所信，惟有中书金维新等人，终日升官晋爵，没有远略。今昆明兵马，不满三万，人无固志。国主您如果出兵，可唾手而得！”
孙可望手下的翰林方于宣也急劝孙可望入云南，取代永历称帝。
回家后，他得意地对家人讲：“国主登基，我必为首相！”
不久，永历帝派白文选来劝孙可望，差点被孙可望杀掉。众将相劝下，孙可望才饶过白文选。
昆明城中，永历帝为树恩威，大肆封赏，任用了一大批官员，惟独户部左侍郎龚彝辞官不受：“为臣在云南受封孙可望十年厚恩，不敢受陛下官。”
云南官员闻之皆很愤怒，指斥他说：“你身为明朝进士，世受国恩三百年而不报，反念孙可望十年之恩，真不是人！”
龚彝恬不知耻，不以为意。他倒不是多么“孤忠”，而是认定孙可望兵多将广，昆明很快就要变天。
不过，路到绝处开生面，人到后来看下场。龚彝这个人，当时广为人所诟病，但后来永历帝被清朝押回昆明，他却以当着皇帝面自杀的方式，作了永历帝生前看到的最后一个南明忠臣。
至于马吉翔，本来已被李定国派手下将领拘押。这个京油子能说会道又出钱，把看押他